Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ScaperF8VQ70 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ScaperF8VQ70 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ScaperF8VQ70 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ScaperF8VQ70 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ScaperF8VQ70 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ScaperF8VQ70 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ScaperF8VQ70 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ScaperF8VQ70 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ScaperF8VQ70 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ScaperF8VQ70 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ScaperF8VQ70 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ScaperF8VQ70 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ScaperF8VQ70 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ScaperF8VQ70 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ScaperF8VQ70 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ScaperF8VQ70 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ScaperF8VQ70 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ScaperF8VQ70 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ScaperF8VQ70 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ScaperF8VQ70 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ScaperF8VQ70 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ScaperF8VQ70 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ScaperF8VQ70 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ScaperF8VQ70 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ScaperF8VQ70 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ScaperF8VQ70 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ScaperF8VQ70 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ScaperF8VQ70 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ScaperF8VQ70 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ScaperF8VQ70 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ScaperF8VQ70 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ScaperF8VQ70 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ScaperF8VQ70 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ScaperF8VQ70 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ScaperF8VQ70 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ScaperF8VQ70 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ScaperF8VQ70 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ScaperF8VQ70 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ScaperF8VQ70 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ScaperF8VQ70 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ScaperF8VQ70 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ScaperF8VQ70 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ScaperF8VQ70 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ScaperF8VQ70 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ScaperF8VQ70 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ScaperF8VQ70 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ScaperF8VQ70 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ScaperF8VQ70 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ScaperF8VQ70 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ScaperF8VQ70 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ScaperF8VQ70 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ScaperF8VQ70 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ScaperF8VQ70 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ScaperF8VQ70 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ScaperF8VQ70 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ScaperF8VQ70 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ScaperF8VQ70 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ScaperF8VQ70 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ScaperF8VQ70 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ScaperF8VQ70 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ScaperF8VQ70 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ScaperF8VQ70 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ScaperF8VQ70 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ScaperF8VQ70 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ScaperF8VQ70 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ScaperF8VQ70 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ScaperF8VQ70 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ScaperF8VQ70 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ScaperF8VQ70 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ScaperF8VQ70 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ScaperF8VQ70 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ScaperF8VQ70 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ScaperF8VQ70 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ScaperF8VQ70 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ScaperF8VQ70 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ScaperF8VQ70 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ScaperF8VQ70 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ScaperF8VQ70 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ScaperF8VQ70 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ScaperF8VQ70 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ScaperF8VQ70 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ScaperF8VQ70 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ScaperF8VQ70 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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