Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 Cacna1c-226ENSMUST00000219833 7591 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 Nup50-201ENSMUST00000165443 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 Pml-202ENSMUST00000114136 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 Pcdhga7-201ENSMUST00000192511 4730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 Pck2-201ENSMUST00000048781 3400 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 Phip-201ENSMUST00000034787 10756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 Dlec1-208ENSMUST00000165231 5263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 Rangap1-201ENSMUST00000052374 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 Tiam2-201ENSMUST00000072156 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 Nek4-207ENSMUST00000228328 4245 ntAPPRIS P2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
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