Protein–RNA interactions for Protein: F6U8B9

Gm17555, Predicted gene, 17555, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17555F6U8B9 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm17555F6U8B9 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm17555F6U8B9 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm17555F6U8B9 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm17555F6U8B9 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm17555F6U8B9 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm17555F6U8B9 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm17555F6U8B9 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm17555F6U8B9 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm17555F6U8B9 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm17555F6U8B9 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm17555F6U8B9 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm17555F6U8B9 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm17555F6U8B9 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm17555F6U8B9 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm17555F6U8B9 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm17555F6U8B9 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm17555F6U8B9 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm17555F6U8B9 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm17555F6U8B9 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm17555F6U8B9 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm17555F6U8B9 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm17555F6U8B9 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm17555F6U8B9 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm17555F6U8B9 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm17555F6U8B9 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm17555F6U8B9 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm17555F6U8B9 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm17555F6U8B9 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm17555F6U8B9 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm17555F6U8B9 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm17555F6U8B9 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm17555F6U8B9 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm17555F6U8B9 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm17555F6U8B9 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm17555F6U8B9 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm17555F6U8B9 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm17555F6U8B9 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm17555F6U8B9 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm17555F6U8B9 2810454H06Rik-201ENSMUST00000189942 3148 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm17555F6U8B9 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm17555F6U8B9 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm17555F6U8B9 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm17555F6U8B9 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm17555F6U8B9 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm17555F6U8B9 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm17555F6U8B9 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm17555F6U8B9 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm17555F6U8B9 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm17555F6U8B9 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm17555F6U8B9 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm17555F6U8B9 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm17555F6U8B9 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm17555F6U8B9 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm17555F6U8B9 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm17555F6U8B9 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm17555F6U8B9 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm17555F6U8B9 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm17555F6U8B9 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm17555F6U8B9 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm17555F6U8B9 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm17555F6U8B9 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm17555F6U8B9 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm17555F6U8B9 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm17555F6U8B9 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm17555F6U8B9 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm17555F6U8B9 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm17555F6U8B9 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm17555F6U8B9 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm17555F6U8B9 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm17555F6U8B9 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm17555F6U8B9 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm17555F6U8B9 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm17555F6U8B9 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm17555F6U8B9 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm17555F6U8B9 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm17555F6U8B9 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm17555F6U8B9 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm17555F6U8B9 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm17555F6U8B9 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm17555F6U8B9 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm17555F6U8B9 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm17555F6U8B9 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm17555F6U8B9 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm17555F6U8B9 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm17555F6U8B9 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm17555F6U8B9 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm17555F6U8B9 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm17555F6U8B9 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm17555F6U8B9 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm17555F6U8B9 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm17555F6U8B9 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm17555F6U8B9 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm17555F6U8B9 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm17555F6U8B9 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm17555F6U8B9 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm17555F6U8B9 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm17555F6U8B9 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm17555F6U8B9 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm17555F6U8B9 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms