Protein–RNA interactions for Protein: F6U3N7

Gm21977, Predicted gene 21977 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21977F6U3N7 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm21977F6U3N7 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm21977F6U3N7 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm21977F6U3N7 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm21977F6U3N7 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm21977F6U3N7 Tyw1-202ENSMUST00000044204 4698 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm21977F6U3N7 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm21977F6U3N7 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm21977F6U3N7 Col6a3-201ENSMUST00000056925 10106 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm21977F6U3N7 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm21977F6U3N7 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm21977F6U3N7 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm21977F6U3N7 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm21977F6U3N7 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm21977F6U3N7 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm21977F6U3N7 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm21977F6U3N7 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm21977F6U3N7 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm21977F6U3N7 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm21977F6U3N7 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21977F6U3N7 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21977F6U3N7 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21977F6U3N7 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21977F6U3N7 Ccdc24-206ENSMUST00000164853 3990 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21977F6U3N7 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21977F6U3N7 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21977F6U3N7 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21977F6U3N7 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21977F6U3N7 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21977F6U3N7 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21977F6U3N7 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21977F6U3N7 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21977F6U3N7 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21977F6U3N7 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21977F6U3N7 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21977F6U3N7 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21977F6U3N7 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21977F6U3N7 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21977F6U3N7 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21977F6U3N7 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21977F6U3N7 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21977F6U3N7 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21977F6U3N7 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21977F6U3N7 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21977F6U3N7 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21977F6U3N7 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21977F6U3N7 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21977F6U3N7 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21977F6U3N7 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21977F6U3N7 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21977F6U3N7 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21977F6U3N7 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21977F6U3N7 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21977F6U3N7 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21977F6U3N7 Rims1-203ENSMUST00000097809 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21977F6U3N7 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21977F6U3N7 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21977F6U3N7 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21977F6U3N7 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21977F6U3N7 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21977F6U3N7 Kdm4a-204ENSMUST00000106406 4663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21977F6U3N7 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21977F6U3N7 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21977F6U3N7 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21977F6U3N7 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21977F6U3N7 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21977F6U3N7 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21977F6U3N7 Ern1-201ENSMUST00000001059 6946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21977F6U3N7 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21977F6U3N7 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21977F6U3N7 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21977F6U3N7 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21977F6U3N7 Kif4-201ENSMUST00000048962 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21977F6U3N7 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21977F6U3N7 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21977F6U3N7 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21977F6U3N7 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21977F6U3N7 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21977F6U3N7 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21977F6U3N7 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21977F6U3N7 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21977F6U3N7 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21977F6U3N7 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21977F6U3N7 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21977F6U3N7 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21977F6U3N7 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21977F6U3N7 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21977F6U3N7 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21977F6U3N7 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21977F6U3N7 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21977F6U3N7 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21977F6U3N7 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21977F6U3N7 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21977F6U3N7 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21977F6U3N7 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21977F6U3N7 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21977F6U3N7 Gm19040-201ENSMUST00000203280 4726 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21977F6U3N7 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21977F6U3N7 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21977F6U3N7 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms