Protein–RNA interactions for Protein: F2Z461

Herc6, E3 ISG15--protein ligase Herc6, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc6F2Z461 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Herc6F2Z461 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Herc6F2Z461 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Herc6F2Z461 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Herc6F2Z461 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Herc6F2Z461 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Herc6F2Z461 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Herc6F2Z461 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Herc6F2Z461 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Herc6F2Z461 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Herc6F2Z461 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Herc6F2Z461 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Herc6F2Z461 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Herc6F2Z461 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Herc6F2Z461 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Herc6F2Z461 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Herc6F2Z461 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Herc6F2Z461 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Herc6F2Z461 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Herc6F2Z461 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Herc6F2Z461 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Herc6F2Z461 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Herc6F2Z461 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Herc6F2Z461 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Herc6F2Z461 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Herc6F2Z461 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Herc6F2Z461 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Herc6F2Z461 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Herc6F2Z461 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Herc6F2Z461 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Herc6F2Z461 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Herc6F2Z461 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Herc6F2Z461 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Herc6F2Z461 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Herc6F2Z461 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms