Protein–RNA interactions for Protein: E9PW72

Gm3002, Predicted gene 3002, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3002E9PW72 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm3002E9PW72 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm3002E9PW72 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm3002E9PW72 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm3002E9PW72 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm3002E9PW72 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm3002E9PW72 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm3002E9PW72 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm3002E9PW72 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm3002E9PW72 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm3002E9PW72 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm3002E9PW72 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm3002E9PW72 2010110E17Rik-201ENSMUST00000184161 879 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm3002E9PW72 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm3002E9PW72 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm3002E9PW72 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm3002E9PW72 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm3002E9PW72 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm3002E9PW72 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm3002E9PW72 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm3002E9PW72 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm3002E9PW72 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm3002E9PW72 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm3002E9PW72 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm3002E9PW72 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm3002E9PW72 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm3002E9PW72 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm3002E9PW72 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm3002E9PW72 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm3002E9PW72 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm3002E9PW72 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm3002E9PW72 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm3002E9PW72 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm3002E9PW72 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm3002E9PW72 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm3002E9PW72 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm3002E9PW72 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm3002E9PW72 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm3002E9PW72 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm3002E9PW72 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm3002E9PW72 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm3002E9PW72 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm3002E9PW72 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm3002E9PW72 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm3002E9PW72 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm3002E9PW72 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm3002E9PW72 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm3002E9PW72 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm3002E9PW72 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm3002E9PW72 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm3002E9PW72 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm3002E9PW72 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm3002E9PW72 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm3002E9PW72 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm3002E9PW72 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm3002E9PW72 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm3002E9PW72 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm3002E9PW72 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm3002E9PW72 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm3002E9PW72 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm3002E9PW72 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm3002E9PW72 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm3002E9PW72 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm3002E9PW72 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm3002E9PW72 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm3002E9PW72 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm3002E9PW72 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm3002E9PW72 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm3002E9PW72 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm3002E9PW72 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm3002E9PW72 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm3002E9PW72 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm3002E9PW72 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3002E9PW72 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3002E9PW72 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3002E9PW72 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3002E9PW72 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3002E9PW72 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3002E9PW72 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3002E9PW72 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3002E9PW72 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3002E9PW72 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3002E9PW72 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3002E9PW72 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3002E9PW72 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3002E9PW72 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3002E9PW72 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3002E9PW72 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3002E9PW72 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3002E9PW72 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3002E9PW72 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3002E9PW72 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3002E9PW72 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3002E9PW72 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3002E9PW72 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3002E9PW72 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3002E9PW72 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3002E9PW72 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3002E9PW72 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3002E9PW72 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
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