Protein–RNA interactions for Protein: B6A8R8

Tarm1, T-cell-interacting, activating receptor on myeloid cells protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarm1B6A8R8 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tarm1B6A8R8 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tarm1B6A8R8 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tarm1B6A8R8 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tarm1B6A8R8 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tarm1B6A8R8 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tarm1B6A8R8 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tarm1B6A8R8 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tarm1B6A8R8 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tarm1B6A8R8 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tarm1B6A8R8 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tarm1B6A8R8 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tarm1B6A8R8 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tarm1B6A8R8 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tarm1B6A8R8 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tarm1B6A8R8 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tarm1B6A8R8 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tarm1B6A8R8 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tarm1B6A8R8 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tarm1B6A8R8 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Tarm1B6A8R8 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Tarm1B6A8R8 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Tarm1B6A8R8 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tarm1B6A8R8 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tarm1B6A8R8 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tarm1B6A8R8 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tarm1B6A8R8 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tarm1B6A8R8 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Tarm1B6A8R8 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tarm1B6A8R8 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tarm1B6A8R8 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tarm1B6A8R8 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tarm1B6A8R8 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tarm1B6A8R8 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tarm1B6A8R8 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Tarm1B6A8R8 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tarm1B6A8R8 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tarm1B6A8R8 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tarm1B6A8R8 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tarm1B6A8R8 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Tarm1B6A8R8 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Tarm1B6A8R8 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Tarm1B6A8R8 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Tarm1B6A8R8 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tarm1B6A8R8 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Tarm1B6A8R8 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tarm1B6A8R8 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tarm1B6A8R8 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tarm1B6A8R8 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tarm1B6A8R8 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tarm1B6A8R8 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tarm1B6A8R8 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tarm1B6A8R8 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tarm1B6A8R8 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tarm1B6A8R8 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tarm1B6A8R8 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tarm1B6A8R8 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tarm1B6A8R8 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tarm1B6A8R8 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tarm1B6A8R8 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tarm1B6A8R8 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tarm1B6A8R8 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tarm1B6A8R8 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tarm1B6A8R8 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tarm1B6A8R8 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tarm1B6A8R8 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tarm1B6A8R8 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tarm1B6A8R8 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tarm1B6A8R8 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tarm1B6A8R8 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tarm1B6A8R8 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tarm1B6A8R8 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tarm1B6A8R8 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tarm1B6A8R8 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tarm1B6A8R8 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tarm1B6A8R8 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tarm1B6A8R8 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tarm1B6A8R8 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Tarm1B6A8R8 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Tarm1B6A8R8 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tarm1B6A8R8 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tarm1B6A8R8 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tarm1B6A8R8 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tarm1B6A8R8 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tarm1B6A8R8 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Tarm1B6A8R8 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tarm1B6A8R8 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tarm1B6A8R8 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tarm1B6A8R8 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tarm1B6A8R8 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tarm1B6A8R8 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tarm1B6A8R8 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tarm1B6A8R8 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tarm1B6A8R8 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tarm1B6A8R8 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Tarm1B6A8R8 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tarm1B6A8R8 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tarm1B6A8R8 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tarm1B6A8R8 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tarm1B6A8R8 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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