Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

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Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Clrn2B2RVW2 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Clrn2B2RVW2 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Clrn2B2RVW2 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Clrn2B2RVW2 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Clrn2B2RVW2 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Clrn2B2RVW2 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Clrn2B2RVW2 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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