Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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