Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Brpf1B2RRD7 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Brpf1B2RRD7 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Brpf1B2RRD7 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Brpf1B2RRD7 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Brpf1B2RRD7 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Brpf1B2RRD7 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Brpf1B2RRD7 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Brpf1B2RRD7 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Brpf1B2RRD7 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Brpf1B2RRD7 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Brpf1B2RRD7 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Brpf1B2RRD7 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Brpf1B2RRD7 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Brpf1B2RRD7 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Brpf1B2RRD7 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Brpf1B2RRD7 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Brpf1B2RRD7 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Brpf1B2RRD7 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Brpf1B2RRD7 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Brpf1B2RRD7 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Brpf1B2RRD7 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Brpf1B2RRD7 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Brpf1B2RRD7 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Brpf1B2RRD7 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Brpf1B2RRD7 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Brpf1B2RRD7 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Brpf1B2RRD7 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Brpf1B2RRD7 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Brpf1B2RRD7 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Brpf1B2RRD7 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Brpf1B2RRD7 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Brpf1B2RRD7 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Brpf1B2RRD7 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Brpf1B2RRD7 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Brpf1B2RRD7 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Brpf1B2RRD7 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Brpf1B2RRD7 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Brpf1B2RRD7 Gm15968-201ENSMUST00000119342 1168 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Brpf1B2RRD7 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Brpf1B2RRD7 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Brpf1B2RRD7 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Brpf1B2RRD7 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Brpf1B2RRD7 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Brpf1B2RRD7 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Brpf1B2RRD7 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Brpf1B2RRD7 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Brpf1B2RRD7 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Brpf1B2RRD7 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Brpf1B2RRD7 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Brpf1B2RRD7 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Brpf1B2RRD7 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Brpf1B2RRD7 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Brpf1B2RRD7 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Brpf1B2RRD7 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Brpf1B2RRD7 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Brpf1B2RRD7 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Brpf1B2RRD7 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Brpf1B2RRD7 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Brpf1B2RRD7 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Brpf1B2RRD7 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Brpf1B2RRD7 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Brpf1B2RRD7 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brpf1B2RRD7 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brpf1B2RRD7 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brpf1B2RRD7 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Brpf1B2RRD7 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brpf1B2RRD7 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brpf1B2RRD7 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brpf1B2RRD7 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brpf1B2RRD7 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brpf1B2RRD7 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brpf1B2RRD7 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brpf1B2RRD7 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brpf1B2RRD7 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Brpf1B2RRD7 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brpf1B2RRD7 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Brpf1B2RRD7 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Brpf1B2RRD7 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Brpf1B2RRD7 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Brpf1B2RRD7 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Brpf1B2RRD7 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Brpf1B2RRD7 4933416E03Rik-201ENSMUST00000133091 1126 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brpf1B2RRD7 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Brpf1B2RRD7 Rpf2-206ENSMUST00000183309 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brpf1B2RRD7 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brpf1B2RRD7 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brpf1B2RRD7 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brpf1B2RRD7 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brpf1B2RRD7 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Brpf1B2RRD7 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brpf1B2RRD7 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brpf1B2RRD7 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brpf1B2RRD7 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brpf1B2RRD7 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.9 ms