Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

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Length 936 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
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