Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Olfr464-205ENSMUST00000217112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
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