Protein–RNA interactions for Protein: A2ASQ1

Agrn, Agrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,950 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AgrnA2ASQ1 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 Bach2os-202ENSMUST00000136149 687 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 AC126799.1-201ENSMUST00000221976 246 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 AC140375.1-201ENSMUST00000225421 694 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 229.9 ms