Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rtf1A2AQ19 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Rtf1A2AQ19 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rtf1A2AQ19 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rtf1A2AQ19 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rtf1A2AQ19 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rtf1A2AQ19 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rtf1A2AQ19 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rtf1A2AQ19 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rtf1A2AQ19 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rtf1A2AQ19 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Rtf1A2AQ19 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rtf1A2AQ19 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtf1A2AQ19 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtf1A2AQ19 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtf1A2AQ19 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtf1A2AQ19 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtf1A2AQ19 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtf1A2AQ19 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtf1A2AQ19 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtf1A2AQ19 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtf1A2AQ19 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtf1A2AQ19 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtf1A2AQ19 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtf1A2AQ19 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtf1A2AQ19 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtf1A2AQ19 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtf1A2AQ19 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtf1A2AQ19 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtf1A2AQ19 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtf1A2AQ19 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtf1A2AQ19 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtf1A2AQ19 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtf1A2AQ19 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtf1A2AQ19 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtf1A2AQ19 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtf1A2AQ19 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtf1A2AQ19 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtf1A2AQ19 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtf1A2AQ19 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtf1A2AQ19 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtf1A2AQ19 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtf1A2AQ19 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtf1A2AQ19 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtf1A2AQ19 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtf1A2AQ19 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtf1A2AQ19 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtf1A2AQ19 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtf1A2AQ19 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtf1A2AQ19 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtf1A2AQ19 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtf1A2AQ19 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtf1A2AQ19 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtf1A2AQ19 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtf1A2AQ19 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtf1A2AQ19 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtf1A2AQ19 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtf1A2AQ19 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtf1A2AQ19 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtf1A2AQ19 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtf1A2AQ19 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtf1A2AQ19 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtf1A2AQ19 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Rtf1A2AQ19 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Rtf1A2AQ19 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtf1A2AQ19 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtf1A2AQ19 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtf1A2AQ19 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtf1A2AQ19 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtf1A2AQ19 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtf1A2AQ19 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtf1A2AQ19 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtf1A2AQ19 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtf1A2AQ19 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtf1A2AQ19 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtf1A2AQ19 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtf1A2AQ19 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtf1A2AQ19 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtf1A2AQ19 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtf1A2AQ19 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtf1A2AQ19 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtf1A2AQ19 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtf1A2AQ19 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtf1A2AQ19 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtf1A2AQ19 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtf1A2AQ19 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtf1A2AQ19 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtf1A2AQ19 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtf1A2AQ19 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtf1A2AQ19 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms