Protein–RNA interactions for Protein: A2ALC6

Gm4985, MCG8129, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4985A2ALC6 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm4985A2ALC6 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm4985A2ALC6 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm4985A2ALC6 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm4985A2ALC6 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Gm4985A2ALC6 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Gm4985A2ALC6 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm4985A2ALC6 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Gm4985A2ALC6 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Gm4985A2ALC6 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm4985A2ALC6 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Gm4985A2ALC6 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm4985A2ALC6 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Gm4985A2ALC6 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Gm4985A2ALC6 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Gm4985A2ALC6 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm4985A2ALC6 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm4985A2ALC6 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm4985A2ALC6 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm4985A2ALC6 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm4985A2ALC6 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm4985A2ALC6 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Gm4985A2ALC6 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm4985A2ALC6 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm4985A2ALC6 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm4985A2ALC6 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm4985A2ALC6 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm4985A2ALC6 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm4985A2ALC6 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm4985A2ALC6 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm4985A2ALC6 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm4985A2ALC6 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm4985A2ALC6 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm4985A2ALC6 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm4985A2ALC6 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm4985A2ALC6 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms