Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms