Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms