Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ubl3Q9Z2M6 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms