Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mbd3Q9Z2D8 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms