Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms