Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUZ7

Sh3bgr, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrQ9WUZ7 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sh3bgrQ9WUZ7 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sh3bgrQ9WUZ7 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sh3bgrQ9WUZ7 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sh3bgrQ9WUZ7 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sh3bgrQ9WUZ7 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sh3bgrQ9WUZ7 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sh3bgrQ9WUZ7 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sh3bgrQ9WUZ7 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sh3bgrQ9WUZ7 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sh3bgrQ9WUZ7 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sh3bgrQ9WUZ7 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sh3bgrQ9WUZ7 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sh3bgrQ9WUZ7 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sh3bgrQ9WUZ7 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sh3bgrQ9WUZ7 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sh3bgrQ9WUZ7 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sh3bgrQ9WUZ7 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sh3bgrQ9WUZ7 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sh3bgrQ9WUZ7 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sh3bgrQ9WUZ7 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sh3bgrQ9WUZ7 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sh3bgrQ9WUZ7 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sh3bgrQ9WUZ7 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Sh3bgrQ9WUZ7 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sh3bgrQ9WUZ7 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sh3bgrQ9WUZ7 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sh3bgrQ9WUZ7 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Sh3bgrQ9WUZ7 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Sh3bgrQ9WUZ7 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sh3bgrQ9WUZ7 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sh3bgrQ9WUZ7 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sh3bgrQ9WUZ7 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sh3bgrQ9WUZ7 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sh3bgrQ9WUZ7 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sh3bgrQ9WUZ7 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Sh3bgrQ9WUZ7 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sh3bgrQ9WUZ7 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sh3bgrQ9WUZ7 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sh3bgrQ9WUZ7 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sh3bgrQ9WUZ7 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sh3bgrQ9WUZ7 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sh3bgrQ9WUZ7 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sh3bgrQ9WUZ7 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sh3bgrQ9WUZ7 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sh3bgrQ9WUZ7 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sh3bgrQ9WUZ7 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sh3bgrQ9WUZ7 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sh3bgrQ9WUZ7 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sh3bgrQ9WUZ7 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sh3bgrQ9WUZ7 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sh3bgrQ9WUZ7 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sh3bgrQ9WUZ7 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Sh3bgrQ9WUZ7 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Sh3bgrQ9WUZ7 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Sh3bgrQ9WUZ7 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sh3bgrQ9WUZ7 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sh3bgrQ9WUZ7 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sh3bgrQ9WUZ7 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sh3bgrQ9WUZ7 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sh3bgrQ9WUZ7 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sh3bgrQ9WUZ7 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sh3bgrQ9WUZ7 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sh3bgrQ9WUZ7 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
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Sh3bgrQ9WUZ7 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sh3bgrQ9WUZ7 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sh3bgrQ9WUZ7 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sh3bgrQ9WUZ7 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sh3bgrQ9WUZ7 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sh3bgrQ9WUZ7 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sh3bgrQ9WUZ7 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sh3bgrQ9WUZ7 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sh3bgrQ9WUZ7 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Sh3bgrQ9WUZ7 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Sh3bgrQ9WUZ7 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Sh3bgrQ9WUZ7 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sh3bgrQ9WUZ7 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sh3bgrQ9WUZ7 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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