Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0G7

Zeb2, Zinc finger E-box-binding homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zeb2Q9R0G7 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zeb2Q9R0G7 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zeb2Q9R0G7 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zeb2Q9R0G7 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zeb2Q9R0G7 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zeb2Q9R0G7 Gm24791-201ENSMUST00000104284 131 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Zeb2Q9R0G7 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zeb2Q9R0G7 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zeb2Q9R0G7 Gm22146-201ENSMUST00000157397 288 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Zeb2Q9R0G7 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Zeb2Q9R0G7 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Zeb2Q9R0G7 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Zeb2Q9R0G7 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zeb2Q9R0G7 Mpv17-206ENSMUST00000201353 846 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zeb2Q9R0G7 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Zeb2Q9R0G7 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zeb2Q9R0G7 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zeb2Q9R0G7 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zeb2Q9R0G7 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zeb2Q9R0G7 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zeb2Q9R0G7 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zeb2Q9R0G7 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zeb2Q9R0G7 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zeb2Q9R0G7 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zeb2Q9R0G7 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zeb2Q9R0G7 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zeb2Q9R0G7 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zeb2Q9R0G7 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zeb2Q9R0G7 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zeb2Q9R0G7 Llph-201ENSMUST00000020444 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zeb2Q9R0G7 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zeb2Q9R0G7 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zeb2Q9R0G7 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zeb2Q9R0G7 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zeb2Q9R0G7 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zeb2Q9R0G7 Nppa-201ENSMUST00000103230 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zeb2Q9R0G7 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zeb2Q9R0G7 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Zeb2Q9R0G7 Rbm3os-201ENSMUST00000124018 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zeb2Q9R0G7 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zeb2Q9R0G7 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zeb2Q9R0G7 1700063K16Rik-201ENSMUST00000190306 369 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Zeb2Q9R0G7 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Zeb2Q9R0G7 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zeb2Q9R0G7 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zeb2Q9R0G7 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zeb2Q9R0G7 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zeb2Q9R0G7 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zeb2Q9R0G7 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zeb2Q9R0G7 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zeb2Q9R0G7 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zeb2Q9R0G7 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zeb2Q9R0G7 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zeb2Q9R0G7 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zeb2Q9R0G7 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zeb2Q9R0G7 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zeb2Q9R0G7 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zeb2Q9R0G7 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zeb2Q9R0G7 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zeb2Q9R0G7 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zeb2Q9R0G7 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zeb2Q9R0G7 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zeb2Q9R0G7 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Zeb2Q9R0G7 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Zeb2Q9R0G7 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zeb2Q9R0G7 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zeb2Q9R0G7 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zeb2Q9R0G7 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zeb2Q9R0G7 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zeb2Q9R0G7 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Zeb2Q9R0G7 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zeb2Q9R0G7 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zeb2Q9R0G7 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zeb2Q9R0G7 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zeb2Q9R0G7 Rpl10-ps1-201ENSMUST00000119438 645 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Zeb2Q9R0G7 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Zeb2Q9R0G7 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zeb2Q9R0G7 Gm45500-201ENSMUST00000211676 803 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Zeb2Q9R0G7 AC154361.2-201ENSMUST00000224747 943 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Zeb2Q9R0G7 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Zeb2Q9R0G7 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Zeb2Q9R0G7 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zeb2Q9R0G7 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zeb2Q9R0G7 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zeb2Q9R0G7 4930465M20Rik-201ENSMUST00000130564 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zeb2Q9R0G7 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Zeb2Q9R0G7 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zeb2Q9R0G7 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zeb2Q9R0G7 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zeb2Q9R0G7 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zeb2Q9R0G7 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zeb2Q9R0G7 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zeb2Q9R0G7 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zeb2Q9R0G7 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zeb2Q9R0G7 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zeb2Q9R0G7 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zeb2Q9R0G7 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zeb2Q9R0G7 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zeb2Q9R0G7 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zeb2Q9R0G7 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms