Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
AmfrQ9R049 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
AmfrQ9R049 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
AmfrQ9R049 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
AmfrQ9R049 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
AmfrQ9R049 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
AmfrQ9R049 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
AmfrQ9R049 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
AmfrQ9R049 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
AmfrQ9R049 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
AmfrQ9R049 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
AmfrQ9R049 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
AmfrQ9R049 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
AmfrQ9R049 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
AmfrQ9R049 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
AmfrQ9R049 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
AmfrQ9R049 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
AmfrQ9R049 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
AmfrQ9R049 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
AmfrQ9R049 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
AmfrQ9R049 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
AmfrQ9R049 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
AmfrQ9R049 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
AmfrQ9R049 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
AmfrQ9R049 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
AmfrQ9R049 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
AmfrQ9R049 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
AmfrQ9R049 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
AmfrQ9R049 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
AmfrQ9R049 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
AmfrQ9R049 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
AmfrQ9R049 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
AmfrQ9R049 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
AmfrQ9R049 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
AmfrQ9R049 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
AmfrQ9R049 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
AmfrQ9R049 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
AmfrQ9R049 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
AmfrQ9R049 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
AmfrQ9R049 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
AmfrQ9R049 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
AmfrQ9R049 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
AmfrQ9R049 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
AmfrQ9R049 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
AmfrQ9R049 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
AmfrQ9R049 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
AmfrQ9R049 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
AmfrQ9R049 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
AmfrQ9R049 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
AmfrQ9R049 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
AmfrQ9R049 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
AmfrQ9R049 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
AmfrQ9R049 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
AmfrQ9R049 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
AmfrQ9R049 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
AmfrQ9R049 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
AmfrQ9R049 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
AmfrQ9R049 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
AmfrQ9R049 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
AmfrQ9R049 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
AmfrQ9R049 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
AmfrQ9R049 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
AmfrQ9R049 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
AmfrQ9R049 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
AmfrQ9R049 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
AmfrQ9R049 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
AmfrQ9R049 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
AmfrQ9R049 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
AmfrQ9R049 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
AmfrQ9R049 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AmfrQ9R049 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AmfrQ9R049 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AmfrQ9R049 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AmfrQ9R049 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AmfrQ9R049 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
AmfrQ9R049 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AmfrQ9R049 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AmfrQ9R049 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AmfrQ9R049 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AmfrQ9R049 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AmfrQ9R049 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AmfrQ9R049 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
AmfrQ9R049 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AmfrQ9R049 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AmfrQ9R049 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
AmfrQ9R049 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AmfrQ9R049 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AmfrQ9R049 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
AmfrQ9R049 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AmfrQ9R049 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
AmfrQ9R049 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AmfrQ9R049 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
AmfrQ9R049 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
AmfrQ9R049 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
AmfrQ9R049 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
AmfrQ9R049 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AmfrQ9R049 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AmfrQ9R049 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
AmfrQ9R049 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AmfrQ9R049 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.7 ms