Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rnf4Q9QZS2 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rnf4Q9QZS2 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rnf4Q9QZS2 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rnf4Q9QZS2 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rnf4Q9QZS2 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rnf4Q9QZS2 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rnf4Q9QZS2 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rnf4Q9QZS2 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rnf4Q9QZS2 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rnf4Q9QZS2 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Rnf4Q9QZS2 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rnf4Q9QZS2 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rnf4Q9QZS2 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rnf4Q9QZS2 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Rnf4Q9QZS2 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rnf4Q9QZS2 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rnf4Q9QZS2 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rnf4Q9QZS2 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rnf4Q9QZS2 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rnf4Q9QZS2 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rnf4Q9QZS2 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rnf4Q9QZS2 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rnf4Q9QZS2 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rnf4Q9QZS2 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rnf4Q9QZS2 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rnf4Q9QZS2 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Rnf4Q9QZS2 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rnf4Q9QZS2 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rnf4Q9QZS2 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rnf4Q9QZS2 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rnf4Q9QZS2 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rnf4Q9QZS2 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf4Q9QZS2 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf4Q9QZS2 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf4Q9QZS2 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf4Q9QZS2 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf4Q9QZS2 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf4Q9QZS2 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf4Q9QZS2 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf4Q9QZS2 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf4Q9QZS2 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf4Q9QZS2 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf4Q9QZS2 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf4Q9QZS2 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf4Q9QZS2 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf4Q9QZS2 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf4Q9QZS2 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf4Q9QZS2 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf4Q9QZS2 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf4Q9QZS2 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf4Q9QZS2 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf4Q9QZS2 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf4Q9QZS2 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf4Q9QZS2 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf4Q9QZS2 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf4Q9QZS2 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf4Q9QZS2 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf4Q9QZS2 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf4Q9QZS2 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf4Q9QZS2 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf4Q9QZS2 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf4Q9QZS2 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf4Q9QZS2 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf4Q9QZS2 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf4Q9QZS2 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf4Q9QZS2 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf4Q9QZS2 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf4Q9QZS2 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf4Q9QZS2 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf4Q9QZS2 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf4Q9QZS2 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf4Q9QZS2 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf4Q9QZS2 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf4Q9QZS2 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf4Q9QZS2 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf4Q9QZS2 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf4Q9QZS2 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf4Q9QZS2 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf4Q9QZS2 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf4Q9QZS2 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf4Q9QZS2 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf4Q9QZS2 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf4Q9QZS2 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf4Q9QZS2 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf4Q9QZS2 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf4Q9QZS2 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf4Q9QZS2 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf4Q9QZS2 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf4Q9QZS2 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf4Q9QZS2 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf4Q9QZS2 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf4Q9QZS2 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf4Q9QZS2 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf4Q9QZS2 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf4Q9QZS2 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf4Q9QZS2 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf4Q9QZS2 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf4Q9QZS2 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf4Q9QZS2 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 426.1 ms