Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Olfr1495-203ENSMUST00000216980 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Pml-202ENSMUST00000114136 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 5033428I22Rik-204ENSMUST00000210633 6652 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Rasgrp4-212ENSMUST00000204194 2993 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Gm42047-202ENSMUST00000212899 4988 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Ank1-205ENSMUST00000117296 6794 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Pask-201ENSMUST00000027493 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Mlh3-202ENSMUST00000166821 5420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Olfr1227-ps1-201ENSMUST00000215627 928 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Gm18165-201ENSMUST00000217426 928 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Cacna1c-209ENSMUST00000187386 6906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Ar-201ENSMUST00000052837 10048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Txlng-201ENSMUST00000041370 3862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Bcl2l11-205ENSMUST00000110341 5036 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Phf21a-202ENSMUST00000068702 6023 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Sema4g-201ENSMUST00000026225 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Cox17-202ENSMUST00000120495 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms