Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

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Length 863 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Sfmbt1Q9JMD1 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Sfmbt1Q9JMD1 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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