Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SrfQ9JM73 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
SrfQ9JM73 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SrfQ9JM73 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SrfQ9JM73 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SrfQ9JM73 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SrfQ9JM73 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SrfQ9JM73 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SrfQ9JM73 Olfr1121-201ENSMUST00000062555 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SrfQ9JM73 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SrfQ9JM73 Olfr845-201ENSMUST00000071259 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SrfQ9JM73 Olfr1076-201ENSMUST00000076263 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SrfQ9JM73 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SrfQ9JM73 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SrfQ9JM73 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SrfQ9JM73 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SrfQ9JM73 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SrfQ9JM73 AC151904.4-201ENSMUST00000219868 1319 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
SrfQ9JM73 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SrfQ9JM73 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
SrfQ9JM73 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SrfQ9JM73 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SrfQ9JM73 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SrfQ9JM73 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SrfQ9JM73 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SrfQ9JM73 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SrfQ9JM73 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SrfQ9JM73 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SrfQ9JM73 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SrfQ9JM73 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SrfQ9JM73 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SrfQ9JM73 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SrfQ9JM73 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SrfQ9JM73 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SrfQ9JM73 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SrfQ9JM73 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SrfQ9JM73 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SrfQ9JM73 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
SrfQ9JM73 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SrfQ9JM73 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SrfQ9JM73 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
SrfQ9JM73 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SrfQ9JM73 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SrfQ9JM73 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SrfQ9JM73 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SrfQ9JM73 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SrfQ9JM73 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SrfQ9JM73 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SrfQ9JM73 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SrfQ9JM73 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SrfQ9JM73 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SrfQ9JM73 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
SrfQ9JM73 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
SrfQ9JM73 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
SrfQ9JM73 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SrfQ9JM73 Gm23673-201ENSMUST00000157474 298 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
SrfQ9JM73 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SrfQ9JM73 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SrfQ9JM73 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SrfQ9JM73 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
SrfQ9JM73 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
SrfQ9JM73 Gm38384-201ENSMUST00000195413 1122 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
SrfQ9JM73 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SrfQ9JM73 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
SrfQ9JM73 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SrfQ9JM73 Msmb-201ENSMUST00000022464 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SrfQ9JM73 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SrfQ9JM73 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
SrfQ9JM73 Gm22005-201ENSMUST00000082795 141 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
SrfQ9JM73 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SrfQ9JM73 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SrfQ9JM73 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SrfQ9JM73 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SrfQ9JM73 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SrfQ9JM73 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
SrfQ9JM73 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SrfQ9JM73 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SrfQ9JM73 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SrfQ9JM73 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SrfQ9JM73 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SrfQ9JM73 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SrfQ9JM73 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SrfQ9JM73 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SrfQ9JM73 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SrfQ9JM73 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SrfQ9JM73 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SrfQ9JM73 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SrfQ9JM73 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
SrfQ9JM73 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SrfQ9JM73 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SrfQ9JM73 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SrfQ9JM73 Gm15225-201ENSMUST00000120449 1017 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
SrfQ9JM73 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SrfQ9JM73 Gm14152-201ENSMUST00000127020 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SrfQ9JM73 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SrfQ9JM73 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SrfQ9JM73 D6Ertd474e-203ENSMUST00000160188 683 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SrfQ9JM73 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SrfQ9JM73 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SrfQ9JM73 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms