Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

Predictions only

Length 815 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tgm1Q9JLF6 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Tgm1Q9JLF6 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tgm1Q9JLF6 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tgm1Q9JLF6 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tgm1Q9JLF6 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tgm1Q9JLF6 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tgm1Q9JLF6 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tgm1Q9JLF6 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tgm1Q9JLF6 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tgm1Q9JLF6 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Tgm1Q9JLF6 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tgm1Q9JLF6 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tgm1Q9JLF6 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tgm1Q9JLF6 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tgm1Q9JLF6 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Tgm1Q9JLF6 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Tgm1Q9JLF6 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tgm1Q9JLF6 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Tgm1Q9JLF6 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Tgm1Q9JLF6 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tgm1Q9JLF6 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tgm1Q9JLF6 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tgm1Q9JLF6 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tgm1Q9JLF6 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tgm1Q9JLF6 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Tgm1Q9JLF6 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tgm1Q9JLF6 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tgm1Q9JLF6 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tgm1Q9JLF6 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tgm1Q9JLF6 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tgm1Q9JLF6 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tgm1Q9JLF6 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tgm1Q9JLF6 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tgm1Q9JLF6 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tgm1Q9JLF6 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tgm1Q9JLF6 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tgm1Q9JLF6 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tgm1Q9JLF6 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tgm1Q9JLF6 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tgm1Q9JLF6 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tgm1Q9JLF6 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tgm1Q9JLF6 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tgm1Q9JLF6 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tgm1Q9JLF6 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tgm1Q9JLF6 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tgm1Q9JLF6 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tgm1Q9JLF6 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tgm1Q9JLF6 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tgm1Q9JLF6 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tgm1Q9JLF6 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tgm1Q9JLF6 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tgm1Q9JLF6 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Tgm1Q9JLF6 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tgm1Q9JLF6 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Tgm1Q9JLF6 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tgm1Q9JLF6 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Tgm1Q9JLF6 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tgm1Q9JLF6 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tgm1Q9JLF6 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tgm1Q9JLF6 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tgm1Q9JLF6 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tgm1Q9JLF6 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tgm1Q9JLF6 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tgm1Q9JLF6 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Tgm1Q9JLF6 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tgm1Q9JLF6 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tgm1Q9JLF6 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tgm1Q9JLF6 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tgm1Q9JLF6 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tgm1Q9JLF6 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tgm1Q9JLF6 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tgm1Q9JLF6 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tgm1Q9JLF6 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tgm1Q9JLF6 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tgm1Q9JLF6 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tgm1Q9JLF6 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tgm1Q9JLF6 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tgm1Q9JLF6 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tgm1Q9JLF6 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tgm1Q9JLF6 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tgm1Q9JLF6 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tgm1Q9JLF6 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tgm1Q9JLF6 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms