Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.1 ms