Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.2 ms