Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQR3

Kcnn1, Small conductance calcium-activated potassium channel protein 1, mousemouse

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Length 537 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnn1Q9EQR3 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 AC156801.1-201ENSMUST00000216158 493 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 AC133598.4-201ENSMUST00000224577 454 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Cbx3-202ENSMUST00000094623 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Kcnn1Q9EQR3 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Gm5583-201ENSMUST00000174328 1519 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Kcnn1Q9EQR3 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Gm5916-201ENSMUST00000168452 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 AC164123.1-201ENSMUST00000213385 447 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 AC122301.3-201ENSMUST00000217707 716 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Gm22005-201ENSMUST00000082795 141 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Kcnn1Q9EQR3 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 4933425M03Rik-201ENSMUST00000195991 1544 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
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Kcnn1Q9EQR3 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Kcnn1Q9EQR3 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Kcnn1Q9EQR3 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Kcnn1Q9EQR3 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Kcnn1Q9EQR3 Gm10338-202ENSMUST00000178623 612 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Gm3012-202ENSMUST00000179486 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 1700015G11Rik-202ENSMUST00000185758 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Gm29235-201ENSMUST00000185786 442 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 AC102569.1-204ENSMUST00000222816 793 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Iapp-201ENSMUST00000041993 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Olfr19-201ENSMUST00000057886 1142 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms