Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC28

Csnk1d, Casein kinase I isoform delta, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1dQ9DC28 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
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Csnk1dQ9DC28 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
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