Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Med27Q9DB40 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Med27Q9DB40 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Med27Q9DB40 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Med27Q9DB40 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms