Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Rasgrp4-213ENSMUST00000204845 3182 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr463-203ENSMUST00000217095 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Lrba-206ENSMUST00000195524 3322 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Gm45165-201ENSMUST00000207763 1631 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Srp54a-207ENSMUST00000110708 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 Sertm1-202ENSMUST00000162201 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 Gm17134-201ENSMUST00000166593 437 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms