Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Z3

Tmem53, Transmembrane protein 53, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem53Q9D0Z3 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Gm12333-201ENSMUST00000155508 2669 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Tmem53Q9D0Z3 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Tmem53Q9D0Z3 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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