Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0N8

Tmem88, Transmembrane protein 88, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem88Q9D0N8 Trp63-207ENSMUST00000115308 2380 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Tiam1-204ENSMUST00000114124 7406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Ints6l-201ENSMUST00000039374 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Zfp957-201ENSMUST00000040802 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Pex26-203ENSMUST00000120066 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Ifih1-201ENSMUST00000028259 5470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Avil-203ENSMUST00000129173 2925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Dysf-211ENSMUST00000168387 6501 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Dqx1-201ENSMUST00000077502 3257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Itgad-201ENSMUST00000033051 3965 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Kansl1-201ENSMUST00000018556 5061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 AC131029.1-201ENSMUST00000226391 2929 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Cyp26b1-205ENSMUST00000205228 4288 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 St7-204ENSMUST00000077080 1887 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Itgad-202ENSMUST00000106237 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Gm28581-201ENSMUST00000186086 2177 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Med24-202ENSMUST00000100500 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Gm13437-201ENSMUST00000122434 1981 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Csnk1g1-214ENSMUST00000206594 2482 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Zfp217-201ENSMUST00000063710 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Zfyve1-201ENSMUST00000048319 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms