Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf2e1Q9D0D5 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.6 ms