Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXK8

Nip7, 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nip7Q9CXK8 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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