Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Gm35507-201ENSMUST00000197932 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Hcrtr2-203ENSMUST00000184757 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
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Sgo1Q9CXH7 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
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