Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Utp23Q9CX11 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Utp23Q9CX11 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Utp23Q9CX11 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Utp23Q9CX11 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Utp23Q9CX11 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Utp23Q9CX11 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Utp23Q9CX11 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Utp23Q9CX11 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Utp23Q9CX11 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Utp23Q9CX11 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Utp23Q9CX11 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Utp23Q9CX11 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Utp23Q9CX11 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Utp23Q9CX11 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Utp23Q9CX11 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Utp23Q9CX11 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Utp23Q9CX11 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Utp23Q9CX11 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Utp23Q9CX11 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Utp23Q9CX11 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Utp23Q9CX11 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Utp23Q9CX11 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Utp23Q9CX11 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Utp23Q9CX11 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Utp23Q9CX11 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Utp23Q9CX11 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Utp23Q9CX11 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Utp23Q9CX11 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Utp23Q9CX11 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Utp23Q9CX11 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Utp23Q9CX11 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Utp23Q9CX11 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Utp23Q9CX11 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Utp23Q9CX11 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Utp23Q9CX11 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Utp23Q9CX11 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Utp23Q9CX11 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Utp23Q9CX11 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Utp23Q9CX11 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Utp23Q9CX11 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Utp23Q9CX11 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Utp23Q9CX11 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Utp23Q9CX11 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Utp23Q9CX11 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Utp23Q9CX11 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Utp23Q9CX11 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Utp23Q9CX11 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Utp23Q9CX11 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Utp23Q9CX11 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Utp23Q9CX11 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Utp23Q9CX11 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Utp23Q9CX11 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Utp23Q9CX11 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Utp23Q9CX11 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Utp23Q9CX11 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Utp23Q9CX11 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Utp23Q9CX11 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Utp23Q9CX11 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Utp23Q9CX11 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Utp23Q9CX11 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Utp23Q9CX11 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Utp23Q9CX11 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Utp23Q9CX11 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Utp23Q9CX11 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Utp23Q9CX11 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Utp23Q9CX11 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Utp23Q9CX11 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Utp23Q9CX11 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Utp23Q9CX11 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Utp23Q9CX11 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Utp23Q9CX11 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Utp23Q9CX11 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Utp23Q9CX11 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Utp23Q9CX11 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Utp23Q9CX11 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Utp23Q9CX11 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Utp23Q9CX11 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Utp23Q9CX11 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Utp23Q9CX11 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Utp23Q9CX11 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Utp23Q9CX11 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Utp23Q9CX11 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Utp23Q9CX11 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Utp23Q9CX11 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Utp23Q9CX11 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Utp23Q9CX11 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Utp23Q9CX11 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Utp23Q9CX11 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Utp23Q9CX11 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Utp23Q9CX11 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Utp23Q9CX11 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Utp23Q9CX11 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Utp23Q9CX11 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Utp23Q9CX11 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Utp23Q9CX11 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Utp23Q9CX11 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Utp23Q9CX11 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Utp23Q9CX11 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Utp23Q9CX11 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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