Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 2900076G11Rik-201ENSMUST00000202297 631 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Gm44745-201ENSMUST00000206563 2723 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Tmem56-207ENSMUST00000155309 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms