Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT3

Snx10, Sorting nexin-10, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx10Q9CWT3 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx10Q9CWT3 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx10Q9CWT3 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx10Q9CWT3 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx10Q9CWT3 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx10Q9CWT3 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx10Q9CWT3 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx10Q9CWT3 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx10Q9CWT3 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx10Q9CWT3 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx10Q9CWT3 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx10Q9CWT3 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx10Q9CWT3 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx10Q9CWT3 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx10Q9CWT3 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx10Q9CWT3 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx10Q9CWT3 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx10Q9CWT3 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx10Q9CWT3 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx10Q9CWT3 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx10Q9CWT3 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx10Q9CWT3 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx10Q9CWT3 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx10Q9CWT3 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx10Q9CWT3 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx10Q9CWT3 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx10Q9CWT3 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx10Q9CWT3 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx10Q9CWT3 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx10Q9CWT3 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx10Q9CWT3 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx10Q9CWT3 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx10Q9CWT3 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx10Q9CWT3 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx10Q9CWT3 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx10Q9CWT3 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx10Q9CWT3 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx10Q9CWT3 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx10Q9CWT3 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx10Q9CWT3 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx10Q9CWT3 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx10Q9CWT3 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx10Q9CWT3 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx10Q9CWT3 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx10Q9CWT3 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx10Q9CWT3 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx10Q9CWT3 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx10Q9CWT3 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx10Q9CWT3 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx10Q9CWT3 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx10Q9CWT3 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx10Q9CWT3 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx10Q9CWT3 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx10Q9CWT3 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx10Q9CWT3 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx10Q9CWT3 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx10Q9CWT3 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx10Q9CWT3 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx10Q9CWT3 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx10Q9CWT3 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx10Q9CWT3 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx10Q9CWT3 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx10Q9CWT3 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx10Q9CWT3 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx10Q9CWT3 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx10Q9CWT3 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx10Q9CWT3 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx10Q9CWT3 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx10Q9CWT3 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx10Q9CWT3 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx10Q9CWT3 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx10Q9CWT3 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx10Q9CWT3 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx10Q9CWT3 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx10Q9CWT3 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx10Q9CWT3 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx10Q9CWT3 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx10Q9CWT3 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx10Q9CWT3 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx10Q9CWT3 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx10Q9CWT3 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx10Q9CWT3 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx10Q9CWT3 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx10Q9CWT3 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx10Q9CWT3 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx10Q9CWT3 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx10Q9CWT3 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx10Q9CWT3 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx10Q9CWT3 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx10Q9CWT3 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx10Q9CWT3 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx10Q9CWT3 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx10Q9CWT3 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx10Q9CWT3 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx10Q9CWT3 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx10Q9CWT3 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx10Q9CWT3 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx10Q9CWT3 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx10Q9CWT3 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx10Q9CWT3 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms