Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Gm6754-201ENSMUST00000117124 913 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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