Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ykt6Q9CQW1 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ykt6Q9CQW1 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Ykt6Q9CQW1 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ykt6Q9CQW1 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ykt6Q9CQW1 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ykt6Q9CQW1 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ykt6Q9CQW1 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Ykt6Q9CQW1 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ykt6Q9CQW1 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ykt6Q9CQW1 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ykt6Q9CQW1 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ykt6Q9CQW1 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Ykt6Q9CQW1 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ykt6Q9CQW1 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ykt6Q9CQW1 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ykt6Q9CQW1 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Ykt6Q9CQW1 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ykt6Q9CQW1 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Ykt6Q9CQW1 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ykt6Q9CQW1 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ykt6Q9CQW1 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ykt6Q9CQW1 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Ykt6Q9CQW1 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ykt6Q9CQW1 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ykt6Q9CQW1 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ykt6Q9CQW1 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ykt6Q9CQW1 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Ykt6Q9CQW1 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Ykt6Q9CQW1 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Ykt6Q9CQW1 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ykt6Q9CQW1 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ykt6Q9CQW1 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Ykt6Q9CQW1 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ykt6Q9CQW1 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Ykt6Q9CQW1 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ykt6Q9CQW1 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ykt6Q9CQW1 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ykt6Q9CQW1 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ykt6Q9CQW1 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ykt6Q9CQW1 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ykt6Q9CQW1 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ykt6Q9CQW1 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ykt6Q9CQW1 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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