Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV0

Prpf8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf8Q99PV0 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Ccdc136-201ENSMUST00000096084 3826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Cmya5-201ENSMUST00000062122 11850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Gm13600-201ENSMUST00000117949 744 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms