Protein–RNA interactions for Protein: Q99N05

Ms4a4d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4D, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4dQ99N05 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Gm28269-201ENSMUST00000189511 559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Gm42783-201ENSMUST00000197075 795 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Gm42710-201ENSMUST00000200608 985 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Gm43893-201ENSMUST00000203362 437 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Speer6-ps1-203ENSMUST00000223482 979 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Stfa2-201ENSMUST00000023619 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Gm38368-201ENSMUST00000193181 1335 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Gm42736-201ENSMUST00000200723 1353 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Gm12532-201ENSMUST00000148448 2684 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ms4a4dQ99N05 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ms4a4dQ99N05 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ms4a4dQ99N05 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ms4a4dQ99N05 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ms4a4dQ99N05 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ms4a4dQ99N05 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ms4a4dQ99N05 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ms4a4dQ99N05 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ms4a4dQ99N05 Cep112-202ENSMUST00000106715 1161 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ms4a4dQ99N05 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ms4a4dQ99N05 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ms4a4dQ99N05 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ms4a4dQ99N05 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ms4a4dQ99N05 BB218582-201ENSMUST00000123623 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ms4a4dQ99N05 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ms4a4dQ99N05 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ms4a4dQ99N05 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ms4a4dQ99N05 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ms4a4dQ99N05 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ms4a4dQ99N05 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ms4a4dQ99N05 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ms4a4dQ99N05 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ms4a4dQ99N05 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ms4a4dQ99N05 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ms4a4dQ99N05 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ms4a4dQ99N05 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ms4a4dQ99N05 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ms4a4dQ99N05 Gm30978-201ENSMUST00000211581 1066 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ms4a4dQ99N05 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ms4a4dQ99N05 Olfr1059-ps1-201ENSMUST00000215214 586 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ms4a4dQ99N05 AC123830.1-201ENSMUST00000217156 609 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms