Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SrrtQ99MR6 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
SrrtQ99MR6 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
SrrtQ99MR6 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SrrtQ99MR6 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SrrtQ99MR6 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
SrrtQ99MR6 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
SrrtQ99MR6 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SrrtQ99MR6 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SrrtQ99MR6 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SrrtQ99MR6 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
SrrtQ99MR6 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SrrtQ99MR6 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SrrtQ99MR6 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SrrtQ99MR6 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SrrtQ99MR6 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SrrtQ99MR6 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SrrtQ99MR6 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SrrtQ99MR6 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SrrtQ99MR6 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SrrtQ99MR6 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SrrtQ99MR6 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SrrtQ99MR6 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SrrtQ99MR6 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SrrtQ99MR6 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SrrtQ99MR6 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SrrtQ99MR6 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SrrtQ99MR6 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SrrtQ99MR6 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SrrtQ99MR6 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SrrtQ99MR6 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SrrtQ99MR6 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SrrtQ99MR6 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SrrtQ99MR6 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SrrtQ99MR6 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SrrtQ99MR6 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SrrtQ99MR6 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms