Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms