Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Gm11544-201ENSMUST00000120215 382 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Gm6471-202ENSMUST00000148734 587 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Rian-208ENSMUST00000182370 352 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Gm40332-201ENSMUST00000199847 938 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Tbc1d24-211ENSMUST00000201583 893 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 AC124356.1-201ENSMUST00000221469 698 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 AC107711.4-201ENSMUST00000228948 440 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Ngp-201ENSMUST00000035061 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Gas7-202ENSMUST00000108680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 AC158777.1-201ENSMUST00000226216 1724 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Gm5808-201ENSMUST00000178090 357 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Gm19013-201ENSMUST00000183895 1222 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Gm19014-201ENSMUST00000184828 1189 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Gm5254-201ENSMUST00000188353 977 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Fkbp6-202ENSMUST00000201534 1287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 AC154433.1-201ENSMUST00000224401 1183 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Ggta1-201ENSMUST00000044255 1221 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Nt5dc1-202ENSMUST00000099973 761 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Mettl18-202ENSMUST00000111490 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Gm13583-202ENSMUST00000151931 1476 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Gm16080-201ENSMUST00000152128 692 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Eif4e1b-210ENSMUST00000152204 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Pax4-202ENSMUST00000164519 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Pax4-203ENSMUST00000171089 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Ighv5-1-201ENSMUST00000193324 353 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Gm45388-201ENSMUST00000209922 1132 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
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PtprtQ99M80 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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PtprtQ99M80 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
PtprtQ99M80 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtprtQ99M80 Olfr874-201ENSMUST00000115004 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtprtQ99M80 Gm15831-201ENSMUST00000156195 516 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtprtQ99M80 Gm5529-201ENSMUST00000165691 891 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PtprtQ99M80 Gm17225-201ENSMUST00000172051 497 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtprtQ99M80 Erg-209ENSMUST00000177450 1280 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtprtQ99M80 Olfr1432-201ENSMUST00000180978 930 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtprtQ99M80 Gm28505-201ENSMUST00000190466 680 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtprtQ99M80 Gm5291-201ENSMUST00000201965 899 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PtprtQ99M80 4930553M12Rik-201ENSMUST00000057837 498 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtprtQ99M80 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtprtQ99M80 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtprtQ99M80 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtprtQ99M80 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtprtQ99M80 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtprtQ99M80 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtprtQ99M80 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtprtQ99M80 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtprtQ99M80 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtprtQ99M80 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtprtQ99M80 Gm13456-201ENSMUST00000118928 1365 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PtprtQ99M80 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtprtQ99M80 Gm8914-201ENSMUST00000101396 1035 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
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