Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms